Fils d'Auguste Borgeaud (1831-1878) et d'Anna Frainnet (1837-1903), Charles Borgeaud naît en 1861 au Sentier (Vaud).
Titulaire d'un doctorat en philosophie (Université d'Iéna, 1883) puis d'un doctorat en droit (Université de Genève, 1886), il poursuit ses recherches académiques à Paris et à Londres, avant de revenir à Genève, pour enseigner l'histoire des institutions politiques de la Suisse dès 1896, puis l'histoire nationale et le droit constitutionnel dès 1898.
En 1901, il épouse Marie Vaucher, fille de Pierre Vaucher, ami et ancien professeur de Charles Borgeaud, qui devient son beau-père à titre posthume.
Son intégration à la Société de Zofingue et son implication dans la fondation de la Société académique sont l'occasion pour lui de développer et d'entretenir d'importantes relations d'amitié qui auront une large part dans sa décision de revenir s'installer à Genève.
Auteur d'importants ouvrages sur l'histoire de la démocratie ou encore l'histoire genevoise et la Réforme, c'est à Charles Borgeaud que l'on doit l'"Histoire de l'Université de Genève", oeuvre monumentale, parue en 4 tomes entre 1900 et 1959, et aboutissement d'une recherche appronfondie qui a débuté en 1894, année où la Société académique lui confie la rédaction d'un ouvrage sur l'histoire de l'Université.
Charles Borgeaud occupe également une place fondementale dans le comité chargé de la conception et de la mise en oeuvre du Monument international de la Réformation.
Éminent historien de Genève, Charles Borgeaud décède à Onex en 1940.
D'après: le prologue, l'épilogue et la chronologie sommaire de Luc Weibel in: Weibel, Luc. "Les essais d'une vie: Charles Borgeaud (1861-1940). Neuchâtel : Alphil, 2013 (Collection Biographie)