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Fils de Théodore Flournoy, Henri est né à Genève en 1886. Après avoir passé une maturité classique en 1904, il entreprend des études médicales à Genève, puis à Berne, Marbourg et Munich. En 1910, il obtient son doctorat de l’Université de Genève. Intéressé par la psychologie de la psychiatrie, il poursuit ses études, notamment au John Hopkins Hospital de Baltimore. Approfondissant ses connaissances psychiatriques, il devient l’élève d’Adolf Meyer avant de fréquenter Sigmund Freud.Chargé de cours à la Faculté de médecine il enseigne la psychopathologie médicale ; parallèlement, il est membre de nombreuses sociétés savantes, enfin, il consacre une large part de son temps à des publications dont le nombre s’élève (brochures, articles, etc) à plus de 140 travaux.En 1921, il épouse Elisabeth Richard ; le couple a deux enfants, Elisabeth, née en 1922 et Olivier, né en 1925 (voir : BGE Ms. fr. 7847, enveloppe 1-5).
Lettres concernant les recherches généaologiques: voir les lettres adressées à Henri Flournoy dans la série Recherches généalogiques concernant la famille: BGE Ms. fr. 7833 - Ms. fr. 7834.
Correspondance et documents conservés dans une enveloppe sur laquelle Henri Flournoy a écrit: "Notices biographiques sur Th. Flournoy dans différentes encyclopédies (correspondance)". De décembre 1931 à 1933, Henri Flournoy adresse à de nombreuses encyclopédies (en Allemagne, Italie, Suède, New York, etc.) des lettres d’introduction suivies d’un texte concernant son père Théodore Flournoy. Avec réponses des maisons d’éditions de ces encyclopédies (38 feuillets).Annexes : divers textes biographiques concernant Th. Flournoy.
La plus grande partie des lettres suivantes étaient conservées dans une enveloppe sur laquelle Henri Flrounoy avait noté : "Lettres reçues "Chargé de cours" [à la Faculté de médecine], 1941
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